前言
1 緒論
1.1 生物信息學(xué)的歷史
1.2 生物信息學(xué)的應(yīng)用
1.3 生物信息學(xué)與其他學(xué)科的關(guān)系


2 生物數(shù)據(jù)庫(kù)介紹
2.1 序列數(shù)據(jù)庫(kù)
2.2 基因組數(shù)據(jù)庫(kù)
2.3 結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
2.4 功能數(shù)據(jù)庫(kù)
2.5 其他數(shù)據(jù)庫(kù)資源


3 序列比對(duì)
3.1 概述
3.2 序列比對(duì)的得分系統(tǒng)
3.3 兩條序列比對(duì)方法
3.4 多條序列比對(duì)方法


4 生物信息學(xué)常用概率統(tǒng)計(jì)學(xué)方法簡(jiǎn)介
4.1 概述
4.2 序列對(duì)位顯著性檢驗(yàn)
4.3 貝葉斯統(tǒng)計(jì)在序列對(duì)位中的應(yīng)用


5 數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
5.1 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
5.2 數(shù)據(jù)庫(kù)搜索相似序列
5.3 序列提交


6 分子系統(tǒng)發(fā)育分析
6.1 系統(tǒng)發(fā)育與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
6.2 距離法
6.3 最大簡(jiǎn)約法
6.4 極大似然法


7 基因組學(xué)與基因預(yù)測(cè)
7.1 引言
7.2 基因組測(cè)序技術(shù)及序列組裝
7.3 功能基因組學(xué)
7.4 比較基因組學(xué)


8 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)
8.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)介
8.2 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)分類及蛋白質(zhì)家族
8.3 三維結(jié)構(gòu)比對(duì)
8.4 蛋白質(zhì)基本性質(zhì)預(yù)測(cè)
8.5 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
8.6 蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
8.7 蛋白質(zhì)互作分析
8.8 藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)


9 轉(zhuǎn)錄組與蛋白質(zhì)組分析
9.1 轉(zhuǎn)錄組與基因芯片簡(jiǎn)介
9.2 基因芯片數(shù)據(jù)采集與分析
9.3 蛋白質(zhì)組簡(jiǎn)介
9.4 雙向凝膠電泳數(shù)據(jù)分析
9.5 蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析


10 Perl語(yǔ)言在生物信息學(xué)中的應(yīng)用
10.1 Perl簡(jiǎn)介
10.2 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和程序控制
10.3 編寫生物信息學(xué)應(yīng)用程序
10.4 BioPerl應(yīng)用