1984年正式成立研究生部。2005年，經(jīng)國家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)成為中醫(yī)藥行業(yè)第一所研究生院�！　∽鳛榕囵B(yǎng)高層次中醫(yī)藥人才的重要基地，研究生院現(xiàn)有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合三個一級學(xué)科所涵蓋的所有學(xué)科專業(yè)的博士、碩士授予權(quán)，具有臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)位授予權(quán)和在職人員申請學(xué)位的資質(zhì)；設(shè)有中西醫(yī)結(jié)合、中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)三個一級學(xué)科的博士后工作站。　　多年來，研究生院在系統(tǒng)學(xué)習(xí)，全面掌握，整理提高方針指引下，充分發(fā)揮中國中醫(yī)科學(xué)院高水平專家云集、科研項目充足、指導(dǎo)教師眾多的優(yōu)勢，積極開展教育教學(xué)改革，著重加強(qiáng)課程體系建設(shè)和教學(xué)質(zhì)量的提高，著力培養(yǎng)研究生的創(chuàng)新精神和實踐能力。