江藩嘉慶間入粵為阮元幕僚，阮元出資刊刻《師承記》，以顧炎武、黃宗羲深入宋儒之室，多騎墻之見，故僅得忝列卷末；后又刊《宋學淵源記》，然不錄自詡宗程朱的桐城方苞、劉大櫆、姚鼐。方東樹與江藩同在阮元幕府，對此大為不滿，故撰《漢學商兌》以駁之。

其書仿朱熹《雜學辨》體例，先摘錄原文，復各為辨正于下。其書首先為理學、道學正名；后引戴震、段玉裁、孫星衍等人由小學入義理之說而一一駁斥，認為尚音韻訓詁名物制度只是小學內(nèi)事而非大學，不可由此得義理之真；末取江藩《國朝經(jīng)師經(jīng)義目錄》有關(guān)論述一一辯駁。

方東樹從弟方宗誠曾為曾國藩、李鴻章幕僚，頗受賞識，故盛推《商兌》，一時大行于世。然至清末民初則批評之聲轉(zhuǎn)多，皮錫瑞謂其純以私意肆其謾罵。近世朱維錚則斥為跳踉叫囂，一味謾罵，可謂罕有學術(shù)價值。但平心而論，書中雖有牽強之處、謾罵之語，且貶漢學家立門戶爭異同而自不知，辨程朱未墮禪而自多用禪語，但針砭漢學，亦有切中其病者，至于辨阮元師、儒之分，下啟近代章太炎、錢穆等人學說，亦不可沒其功。

《漢學商兌》道光六年初刻本世所未睹，今所行*早刊本為道光十一年辛卯冬重刊本。后又有同治十年望三益齋刻本、六安求我齋刻本等十余種。此次整理，道光辛卯本為底本，并參校諸本，施以新式標點。