數(shù)量生態(tài)學(xué)是指利用數(shù)學(xué)分析方法定量研究和解決生態(tài)問題的一門課程,是生態(tài)學(xué)方向研究生的一門專業(yè)必修課。針對生態(tài)學(xué)研究中常用的方法,《實用數(shù)量生態(tài)學(xué)》進(jìn)行了詳細(xì)介紹,并給出了極其詳細(xì)的案例計算!秾嵱脭(shù)量生態(tài)學(xué)》分為七個章節(jié),包括數(shù)據(jù)整理與準(zhǔn)備、多樣性指數(shù)計算、種間關(guān)系分析、生態(tài)位、空間格局分析、排序、群落數(shù)量分類方法等。在介紹完具體計算原理與實例后,還為分析方法提供了標(biāo)準(zhǔn)化的通用MATLAB 語言源程序,供探究細(xì)節(jié)的讀者研習(xí)使用。
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目錄
前言
第一章 數(shù)據(jù)整理與準(zhǔn)備 1
第一節(jié) 數(shù)據(jù)的類型 1
一、名稱數(shù)據(jù) 1
二、順序?qū)傩詳?shù)據(jù) 2
三、數(shù)量屬性數(shù)據(jù) 3
第二節(jié) 數(shù)據(jù)預(yù)處理 3
一、數(shù)據(jù)簡縮 4
二、數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換 4
三、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 6
第三節(jié) 預(yù)處理的MATLAB實現(xiàn) 14
一、MakeExcelFileName函數(shù) 14
二、MakeExcelColumnName函數(shù) 15
三、OutputExcel函數(shù) 16
四、DataTransform函數(shù) 17
五、StandardizeData函數(shù) 19
第二章 多樣性指數(shù)計算 25
第一節(jié) 物種多樣性指數(shù) 25
一、α多樣性指數(shù) 25
二、α多樣性計算的MATLAB實現(xiàn) 31
三、β多樣性指數(shù) 37
第二節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育多樣性 40
一、群落系統(tǒng)發(fā)育α多樣性指數(shù) 40
二、群落系統(tǒng)發(fā)育β多樣性指數(shù) 42
第三節(jié) 功能多樣性 44
一、功能α多樣性指數(shù) 45
二、功能β多樣性指數(shù) 47
第三章 種間關(guān)系分析 49
第一節(jié) 種間關(guān)聯(lián) 49
一、總體關(guān)聯(lián)性分析 49
二、種對間關(guān)聯(lián)性分析 51
三、種間關(guān)聯(lián)計算的MATLAB實現(xiàn) 54
第二節(jié) 種間相關(guān) 61
一、Pearson相關(guān)系數(shù) 61
二、Spearman相關(guān)系數(shù) 63
第三節(jié) 種間分離 65
一、Pielou分離指數(shù) 66
二、Pielou分離指數(shù)的MATLAB實現(xiàn) 68
第四節(jié) 種間競爭 71
一、競爭強(qiáng)度 71
二、競爭指數(shù)的MATLAB實現(xiàn) 72
第四章 生態(tài)位 74
第一節(jié) 生態(tài)位測度計算 75
一、生態(tài)位寬度計算 75
二、生態(tài)位重疊指數(shù) 77
三、生態(tài)位分離 85
四、多物種生態(tài)位重疊指數(shù) 85
五、生態(tài)位重疊的應(yīng)用 85
第二節(jié) 生態(tài)位計算的MATLAB實現(xiàn) 86
一、niche函數(shù) 86
二、WangOverlap函數(shù) 90
三、nobp函數(shù) 92
第五章 空間格局分析 93
第一節(jié) 種群分布類型及其判定 93
一、植物分布類型與模型描述 93
二、分布格局類型的驗證 94
第二節(jié) 單種群格局規(guī)模分析 103
一、等級方差分析法 104
二、雙項軌跡方差法 108
三、隨機(jī)配對法 112
第三節(jié) 單種群格局紋理分析 118
一、斑塊-間隙分析法 118
第四節(jié) 大尺度格局分析 123
一、趨勢面分析 123
二、典范趨勢面分析 131
第六章 排序 147
第一節(jié) 極點排序法 148
一、步驟 148
二、實例計算 149
三、極點排序法的MATLAB實現(xiàn) 151
第二節(jié) 主成分分析法 155
一、主成分分析概述 155
二、主成分分析排序步驟 156
三、實例計算 157
四、主成分分析的MATLAB實現(xiàn) 160
第三節(jié) 典范主成分分析法 164
一、原理與步驟 164
二、實例計算 165
三、典范主成分排序的MATLAB實現(xiàn) 168
第四節(jié) 主坐標(biāo)分析法 171
一、原理與步驟 171
二、實例計算 173
三、主坐標(biāo)分析的MATLAB實現(xiàn) 174
第五節(jié) 對應(yīng)分析法 178
一、原理與步驟 178
二、實例計算 179
三、對應(yīng)分析排序的MATLAB實現(xiàn) 181
第六節(jié) 修訂型對應(yīng)分析法 186
一、原理與步驟 186
二、實例計算 187
三、修訂型CA/RA排序的MATLAB實現(xiàn) 190
第七節(jié) 除趨勢對應(yīng)分析法 193
一、原理與步驟 193
二、實例計算 194
三、除趨勢對應(yīng)分析的MATLAB實現(xiàn) 196
第八節(jié) 典范對應(yīng)分析法 200
一、原理與步驟 200
二、實例計算 202
三、典范對應(yīng)分析的MATLAB實現(xiàn) 206
第九節(jié) 除趨勢典范對應(yīng)分析法 213
一、原理與步驟 213
二、實例計算 213
三、除趨勢典范對應(yīng)分析的MATLAB實現(xiàn) 216
第七章 群落數(shù)量分類 222
第一節(jié) 相似的表達(dá)方法 222
一、僅適用于二元數(shù)據(jù)的相似關(guān)系 223
二、適用于二元數(shù)據(jù)和數(shù)量數(shù)據(jù)的相似關(guān)系 230
第二節(jié) 等級聚類法 235
一、等級聚類方法的步驟 235
二、幾種常用的聚合策略 238
三、等級聚類分析的MATLAB實現(xiàn) 240
第三節(jié) 關(guān)聯(lián)分析法 243
一、原理與步驟 243
二、實例計算 244
三、關(guān)聯(lián)分析法的MATLAB實現(xiàn) 248
第四節(jié) 雙向指示種分析法 254
一、原理與步驟 254
二、實例計算 255
三、雙向指示種分析法的MATLAB實現(xiàn) 260
主要參考文獻(xiàn) 272