《云自在龕叢書》五集三十五種，刊于光緒間，主要收輯六朝、唐、宋、清代學(xué)者的著述，是一部以輯校古籍為主，又兼有搜奇集異、匯集從殘?zhí)攸c的叢書。其中所收有些頗為罕見之佚書，如趙矢一《奉天錄》為唐人舊笈，原書久亡，乾隆間四庫館臣從《永樂大典》輯出，但《四庫全書》未收。后來徐松得到稿本，用活字印行，顧廣圻曾�？�，由秦恩復(fù)刊行，因其流傳罕見，繆氏收入?yún)矔�。繆氏�？檀藭鴺O為認真，一些書的質(zhì)量高于前人所刊。如孫光憲《北夢瑣言》糾正了不少《雅雨堂叢書》本的錯誤，并從《太平廣記》輯出了四卷逸文。葉德輝曾稱贊此書“多補刻故書闕文，亦單刻宋元舊本，雖《平津館》《士禮居》不能過之，孫、黃復(fù)生，當把臂入林矣”，認為此書可與《平津館叢書》《士禮居叢書》相提并論，孫星衍、黃丕烈如果復(fù)生，也要承認此書的價值。但《云自在龕叢書》刊成已過百年，線裝原書不便翻檢，因此據(jù)繆荃孫最終編訂五集之本影印，以便學(xué)者利用。