定 價(jià):128 元
叢書名:普通高等教育“十三五”規(guī)劃教材普通高等院校工程實(shí)踐系列規(guī)劃教材
- 作者:陳浩峰主編
- 出版時(shí)間:2016/6/1
- ISBN:9787030487919
- 出 版 社:科學(xué)出版社
- 中圖法分類:Q343.1
- 頁碼:360
- 紙張:膠版紙
- 版次:1
- 開本:32開
新一代基因組測(cè)序技術(shù)是目前生命科學(xué)領(lǐng)域中發(fā)展非?斓男录夹g(shù),它的出現(xiàn)極大地推動(dòng)了生物學(xué)、農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)診斷等學(xué)科各方面的發(fā)展,其應(yīng)用非常廣泛。本書以新一代基因組測(cè)序技術(shù)Illumina平臺(tái)和PacBioRS平臺(tái)為代表,詳細(xì)闡述了從實(shí)驗(yàn)樣品處理到數(shù)據(jù)分析的整個(gè)過程,重點(diǎn)介紹了新一代測(cè)序技術(shù)實(shí)踐過程中的文庫構(gòu)建與質(zhì)檢、測(cè)序儀器操作和測(cè)序數(shù)據(jù)的初步處理及分析。本書是國內(nèi)第一本詳細(xì)闡述新一代基因組、轉(zhuǎn)錄組等測(cè)序技術(shù)的中文書,包含了目前**的技術(shù)資料,極具實(shí)用性和可操作性。
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目 錄
第一章 測(cè)序技術(shù)發(fā)展概述1
第一節(jié) 第一代基因測(cè)序方法簡(jiǎn)介1
第二節(jié) 新一代測(cè)序技術(shù)概述4
參考文獻(xiàn)21
第二章 Illumina測(cè)序建庫25
第一節(jié) DNA測(cè)序建庫25
第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)建庫80
第三節(jié) 小RNA測(cè)序建庫163
第四節(jié) 簡(jiǎn)化基因組測(cè)序建庫184
第五節(jié) 目標(biāo)序列捕獲測(cè)序建庫204
第六節(jié) 單細(xì)胞測(cè)序建庫227
參考文獻(xiàn)244
第三章 Illumina儀器操作246
第一節(jié) 簇生成操作流程246
第二節(jié) 測(cè)序儀HiSeq操作流程254
第三節(jié) 測(cè)序儀MiSeq操作流程268
第四節(jié) 測(cè)序儀NextSeq500 操作流程276
參考文獻(xiàn)283
第四章 Illumina測(cè)序數(shù)據(jù)分析方法簡(jiǎn)介284
第一節(jié) 下機(jī)數(shù)據(jù)的初步處理284
第二節(jié) DNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析簡(jiǎn)介291
第三節(jié) 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)信息分析304
第四節(jié) 建造中等高性能計(jì)算機(jī)群系統(tǒng)316
參考文獻(xiàn)323
第五章 PacBio RS測(cè)序技術(shù)326
第一節(jié) PacBio RS測(cè)序原理326
第二節(jié) PacBio RS測(cè)序DNA樣品準(zhǔn)備及文庫構(gòu)建流程328
第三節(jié) SMRT Potal二級(jí)分析軟件的安裝333
第四節(jié) SMRT Portal數(shù)據(jù)分析流程334
第五節(jié) PacBio RS測(cè)序應(yīng)用簡(jiǎn)介348
第六節(jié) PacBio測(cè)序案例349
參考文獻(xiàn)350
常用英文簡(jiǎn)寫列表351